Der er mange ting at have in mente, når man står og skal vælge fagforening. Mest af alt bør man overveje, om man ønsker en fagspecifik forening eller ønsker at være medlem af en bredere forening med en større gennemslagskraft, men knap så megen ekspertise på det enkelte fagområde.
Flere af de tværfaglige fagforeninger bliver også kaldt ”gule” fagforeninger. Disse er lønmodtagerorganisationer, som optræder i konkurrence med de mere etablerede fagforeninger. De står nemlig uden for de traditionelle fagforeninger som LO, FTF og AC. De har et grundlæggende andet syn på forholdet mellem arbejdsgiver og lønmodtager. De anerkender typisk ikke interessekonflikten, hvorfor de arbejder med få eller slet ingen overenskomster. Kritikere af disse fagforeninger hævder, at de udvander fagforeningernes arbejde mere generelt, da de ofte benytter sig af de overenskomster, som de almindelige fagforeninger har forhandlet hjem, dog uden at betale for omkostninger forbundet med dette. På den anden side er de gule fagforeninger opstået som et behov for at vælge mindre politiske fagforeninger.
De tværfaglige fagforeninger har i højere grad flere faggrupper samlet under ét tag og er derfor det sted, som selvstændige oftest søger hen. Det er gerne fagforeninger med et billigere kontingent.